MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020971	A	6	6	1803	1808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020971	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020971	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020971	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020971	T	7	7	1847	1853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020971	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020971	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020971	T	6	6	2239	2244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020971	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020971	T	7	7	2261	2267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020971	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020971	A	6	6	2333	2338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020971	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020971	A	6	6	5666	5671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020971	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020971	CAAAAA	2	12	6850	6861	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020971	GGAG	2	8	6904	6911	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020971	CTT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020971	TATG	2	8	7553	7560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020971	GA	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020971	A	6	6	7611	7616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020971	TATTT	2	10	7632	7641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020971	ATTT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020971	TTA	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020971	ATTT	2	8	7785	7792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020971	GAA	2	6	7801	7806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020971	ATG	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020971	A	6	6	9730	9735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020971	TTC	3	9	9775	9783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020971	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020971	A	6	6	9815	9820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020971	GAA	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020971	A	6	6	9885	9890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020971	TATT	2	8	9909	9916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020971	CCT	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020971	AG	3	6	9951	9956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020971	TAG	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020971	AGAA	2	8	11803	11810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020971	CTT	2	6	11843	11848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020971	TA	3	6	11849	11854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020971	TCA	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020971	AAT	2	6	13866	13871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020971	ACC	2	6	13877	13882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020971	GGTGT	2	10	13907	13916	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020971	TA	3	6	13940	13945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020971	ATT	2	6	13974	13979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020971	AAG	2	6	13991	13996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020971	TTA	2	6	14017	14022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020971	AAGG	2	8	14039	14046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020971	AAG	2	6	14051	14056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020971	AAC	2	6	14135	14140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020971	TA	4	8	14164	14171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020971	CTT	2	6	15558	15563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020971	CAAA	2	8	16673	16680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020971	AG	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020971	GA	3	6	18129	18134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020971	GTT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020971	AGA	2	6	18977	18982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020971	AAT	3	9	19039	19047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020971	CT	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020971	TCT	2	6	19067	19072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020971	CTT	3	9	20493	20501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020971	T	6	6	20500	20505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020971	T	6	6	20507	20512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020971	GAA	2	6	21018	21023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020971	A	6	6	21080	21085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020971	AG	3	6	21117	21122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020971	A	6	6	21155	21160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020971	GGA	2	6	21212	21217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020971	AGA	3	9	21252	21260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020971	GA	3	6	21275	21280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020971	TGG	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020971	AAC	2	6	21510	21515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020971	AGC	2	6	21527	21532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020971	GCCA	2	8	21621	21628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020971	TGA	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020971	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020971	TCC	2	6	21845	21850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020971	CT	3	6	21861	21866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020971	CGCT	2	8	21869	21876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020971	TTAA	2	8	21890	21897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020971	GTTA	2	8	21927	21934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020971	GATC	2	8	21982	21989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020971	AAT	2	6	22021	22026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020971	A	7	7	25161	25167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020971	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020971	T	9	9	25189	25197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020971	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020971	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020971	ACT	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020971	A	6	6	27144	27149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020971	T	7	7	27156	27162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020971	T	7	7	28470	28476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020971	TAA	2	6	28481	28486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020971	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020971	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020971	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020971	AGA	2	6	28593	28598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020971	AAAGA	2	10	33693	33702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020971	CTG	2	6	33722	33727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020971	GA	3	6	36985	36990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020971	T	9	9	37019	37027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020971	CTT	2	6	37079	37084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020971	AT	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020971	CT	3	6	39354	39359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020971	TAA	2	6	39417	39422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020971	T	6	6	39437	39442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020971	AAG	2	6	39458	39463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020971	A	8	8	40715	40722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020971	CT	3	6	40725	40730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020971	T	6	6	40730	40735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020971	CTC	2	6	40736	40741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020971	AAG	2	6	40821	40826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020971	T	8	8	40911	40918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020971	CT	3	6	42917	42922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020971	TGCAA	2	10	42928	42937	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020971	A	6	6	43182	43187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020971	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020971	A	7	7	43231	43237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020971	CAAAA	2	10	43246	43255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020971	A	7	7	43252	43258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020971	GAT	2	6	43276	43281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020971	AAG	2	6	43282	43287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020971	AG	3	6	43316	43321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020971	A	6	6	43322	43327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020971	GGA	2	6	43334	43339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020971	TAA	2	6	43432	43437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020971	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020971	TGTT	2	8	44417	44424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020971	A	8	8	44456	44463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020971	T	7	7	44539	44545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020971	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020971	AAG	2	6	44573	44578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020971	GGA	2	6	44617	44622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020971	AATA	2	8	44656	44663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020971	ACT	2	6	44664	44669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020971	AAG	2	6	46515	46520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020971	AAGT	2	8	48579	48586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020971	TAA	2	6	48588	48593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020971	GAAGA	2	10	48612	48621	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020971	G	6	6	48622	48627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020971	AG	3	6	48644	48649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020971	TGT	2	6	48663	48668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020971	T	8	8	49209	49216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020971	TAGCAT	2	12	49222	49233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_020971	GTC	2	6	49347	49352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020971	AAG	2	6	49369	49374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020971	TAT	2	6	49398	49403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020971	T	8	8	49492	49499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020971	A	6	6	49543	49548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020971	T	6	6	49653	49658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020971	AGA	2	6	50168	50173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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